2007年1月11日，由国务院办公厅、国务院信息化工作办公室主办的 “第五届（2006）中国政府网站绩效评估结果发布暨经验交流会”在北京召开。科技部在2006年中国政府网站绩效评估中位于76个部委网站的第三名。评估报告指出：“科技部网站政务公开、在线办事、公众参与三大功能均衡发展，充分体现了科技部网站综合发展、全面进步的建设方针。”